במהלך טיפול הסרת הקעקוע בלייזר עוברים על הקעקוע עם קרן לייזר שמתאימה לצבע הקעקוע, אנרגיית הלייזר גורמת לפירוק הצבע.

במהלך הטיפול המטופל ירגיש תחושת חום או צריבה באזור הקעקוע. 

לאחר הטיפול הסרת קעקוע, המקום יהיה רגיש למגע ועלולה להיות אדמומיות ונפיחות של העור. תופעות אלו יעברו לאחר יום יומיים. לעיתים מספר ימים לאחר מכן עלול להיות קילוף עדין של העור באזור הקעקוע ממש כמו לאחר היצירה שלו. עקב הקילוף העור באזור הטיפול עלול להיות יבש יותר מהרגיל למשך כ-14 יום. יובש העור עלול לגרום לתחושת גרד בעור. אסור לגרד את העור בזמן ההחלמה וגם אסור לקלף את העור. יש למרוח קרם לחות מספר פעמים ביום שיזין את העור וירגיע את תחושת הגרד.

בתקופה שבין הטיפולים מחיקת קעקוע בלייזר, צבע הקעקוע יתפרק וייצא מהגוף דרך מערכת הלימפה. תהליך זה יכול לקחת כ 8-12 שבועות ולכן הטווח בין טיפול לטיפול הוא חודשיים לפחות. פירוק ופינוי הצבע הוא לא תהליך שניראה לעין ויש לעשות מספר טיפולי לייזר בכדי להבחין בשינוי. 7 ימים לפני הטיפול ו-7 ימים לאחר הטיפול אסור לחשוף את אזור הטיפול לשמש, זה יכול לעשות פיגמנטציה. מלבד הימים האלה מומלץ להשתמש בקרם הגנה מהשמש עם מקדם הגנה גבוה. 

טיפול מתבצע במכשיר לייזר שמתאים במיוחד להסרת קעקועים וע"י מומחה מנוסה שמוסמך לעשות את הטיפול. הגנה מפני שמש ושמירה על הנחיות של המומחה המטפל יעזרו להצלחת הטיפול.